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张文宏:新冠病毒变异,现没法证实D614G突变病毒株毒性更强

张文宏称,目前无证据证实D614G变异毒株毒性更强。

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7月6日,上海复旦大学附属西岳医院感染科主任张文宏在微博中表示:目前的证据还没法证实D614G突变病毒株的毒性更强,而且D614G突变不太可能对目前正在研制的疫苗的疗效产生重大影响。

但是在疫情逐步进入深水区之际,后续还会有较多的不肯定性,还需要更多实验验证和监测变异现象。

当天,“西岳感染”微信公众号发表了1篇题为《D614G突变:是不是预示病毒传播失控与疫苗失效》的文章,详细解释,D614G突变是不是会影响现在的检测、医治和疫苗研究。

附:“西岳感染”微信公众号文章

《D614G突变:是不是预示病毒传播失控与疫苗失效》

2020年7月3日,cell杂志的1篇研究显示29%的新冠病毒样本都出现了D614G的变异,带有该变异的病毒早已在欧洲及美洲传播,并且感染细胞的能力较前增强,是不是预示病毒传播力增强和对还没有上市的疫苗造成失效风险呢?特别是北京这次疫情反弹中发现的病毒株也有这个突变,后续会对我国疫情会造成甚么样的影响呢?

甚么是D614G突变?

冠状病毒广泛的宿主性和本身基因组的结构特点使其在进化进程中易产生基因重组,显现遗传多样性。D614G突变指的是新冠病毒的第614氨基酸位点D(天冬氨酸)到G(甘氨酸)的突变,位于S蛋白(图1)。D614G突变的病毒株常伴随5'UTR中的C到T突变(相对MN908947.3基因组的241位),3037位的C到T突变;在14408位的C到T突变。包括这4个遗传连锁突变的单倍型现已成为全球优势情势,根据GISAID数据库公布的新冠病毒测序结果,发现携带该突变的病毒株主要归类于G型、GR型和GH型。

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图片来源:左图源自网络;右图源自ZhangL,JacksonCB,MouH,etal.TheD614GmutationintheSARS-CoV⑵spikeproteinreducesS1sheddingandincreasesinfectivity[J].bioRxiv,2020.

为何如此关注D614G突变病毒株?

截止到目前,根据GISAID数据库上公布的所有新冠病毒基因组序列上1共发现了超过1万个不同位点突变,但D614G引发了广泛的关注。

1)传播范围、数量和占比方面:今年3月份之前,携带有这个突变的各型病毒株还远没有成为全球主流,仅占全球所公布的病毒株测序序列的不到10%。在欧洲最早发现后不断分散传播到北美洲、大洋洲、南美洲和亚洲,全部3月,这个数字猛增到了60⑺0%。截止到6月底已超过90%。因此,携带有这个突变的病毒株已成了传播的主要基因型(图2)。

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图片来源:KorberB,FischerWM,GnanakaranS,etal.TrackingchangesinSARS-CoV⑵Spike:evidencethatD614GincreasesinfectivityoftheCOVID⑴9virus[J].Cell,2020.;DaniloskiZ,GuoX,SanjanaN,etal.TheD614GmutationinSARS-CoV⑵Spikeincreasestransductionofmultiplehumancelltypes[J].bioRxiv,2020.

2)潜伏功能方面:D614G突变是1个错译突变(改变氨基酸的变异),而且该突变位于新冠病毒的刺突蛋白(spikeprotein,S蛋白)上(图3),该蛋白是新冠病毒入侵人体细胞的核心武器,也是目前许多疫苗和疗法所重点针对的目标。

因此,刺突蛋白上的突变更容易吸引众多研究人员的注意—这些突变可能会改变刺突蛋白的结构、性质和活力,进而让病毒更加容易入侵人体细胞。

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图片源自网络

为什么D614G脱颖而出,席卷全球?

携带D614G突变的病毒株在2月才首次被发现,但不是在全球范围内同时爆发出现,D614G变异初期出现在欧洲,当时只占到全球新冠病毒测序序列的10%不到,然后才不断分散传播到北美洲、大洋洲、南美洲和亚洲,经过4个多月的传播,成为目前传播的主要基因型。

这1现象是由于该突变改变了刺突蛋白的活性,提高了病毒的“攻击性”和“传播性”,进而让病毒更加容易入侵人体细胞么?

后续在该篇cell发表的文章中,一样用体外感染实验后计算病毒载量发现D614G突变体病毒载量更高。另外,多个团队在人肺上皮细胞、hACE2细胞中发现D614G突变的感染能力增强。

但Cell杂志同期发表的评论性文章指出,的确带有D614G变异的新冠病毒在全球范围内成了统治性传播的病毒株,同时也给出了支持D614G变异病毒提升新冠病毒感染细胞能力细胞实验结果。

但D614G变异是不是会增强新冠病毒感染人的能力和毒性,目前依然不能肯定,需要更多的临床数据支持。这些检测没有斟酌其他病毒或宿主蛋白质的影响,和宿主和病原体之间相互作用等来支持感染和传播。

G614出现频率的增加是不是必定与传播性增加相干呢?不1定!还多是与大流行的流行病学偶然性来解释的。

2月份以后,中国疫情得到控制,欧洲病例成为世界主流,3月份美国病例又成为主流,美国的绝大多数SARS-CoV⑵世系来自欧洲。

病毒分型是不是能在1个地区建立起来,不但与传播有关,还与它们被引入的次数有关。

因此,中国在国内防控稳定以后,加强对输入的防控,在G614成为全球多数变种的这段时间里,以D614仍占主导地位的中国由于控制了输入性病例的传播,病毒引进数量在急剧降落。

虽然这次北京疫情中发现了这个D614G突变株,但是由于采取了迅速果断的防控措施,使得G614的病毒失去了在中国大幅度扩增的机会。

同时,中国的抗疫工作获得了巨大的成果,致使D614病毒株在国内传播有效控制,在世界上的比例愈来愈小,D614G突变病毒株在欧洲和美洲传播进程中没有其他竞争对手,致使了1家独大的现状。

携带D614G突变的新冠病毒株“毒性”更强么?

Korber等在英国的COVID⑴9病例中发现感染G614突变体病毒的患者病毒RNA水平较高,但在住院结果上没有发现差异。有学者提出D614G突变和疾病死亡率(casefatalityrates)有强相干性,但仍停留在统计学的关联分析。

首先,不能单用病毒RNA载量来衡量疾病严重程度,无症状感染者中也存在高滴度病毒,并且以上分析均为关联统计学分析,无明确证据。

同时,目前的证据提示,D614G对COVID⑴9的重要性低于其他风险因素,如年龄或其他基础疾病。因此,目前证据没法证实D614G突变病毒株的毒性更强。

D614G突变会影响现在的检测、医治和疫苗研究么?

核酸检测上目前推荐选用针对新型冠状病毒的开放读码框1ab(openreadingframe,ORF1ab)、核壳蛋白(nucleoprotein,N)基因区域的引物和探针。根据WHO指南,2019-nCoV引物和探针组设计中N3用于通用检测SARS样冠状病毒,N1和N2用于特异性检测SARS-CoV⑵,因此D614G突变不影响病毒的核酸检测。

刺突蛋白的受体结合区域(RBD)是目前许多疫苗和疗法所重点针对的目标,D614G其实不位于RBD区域。同时,自然感染含有D614或G614的病毒产生的抗体可以交叉中和,因此目前来看,D614G突变不太可能对目前正在研制的疫苗的疗效产生重大影响。

另外,目前没有证据表明D614G突变会干扰医治策略,如设计破坏与ACE2的spike结合的单克隆抗体的药物。

但是,在我们更好地理解D614G在自然感染SARS-CoV⑵中的作用之前,任何疫苗或医治设计都应当斟酌到该突变的存在和可能的影响。

在新冠病毒的突变中,D614G突变的病毒株由于其的传播及潜伏功能“脱颖而出”,但是病毒株延续在变异,目前还没有充分证据证明D614G突变的病毒株的感染性,毒性有加强,还没有观测到对疫苗和检测的重要影响,后续需要更多实验验证和监测变异的现象。

【来源:23里资讯】

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牛津专家:愈来愈多的证据表明新冠并不是源自中国

牛津专家:愈来愈多的证据表明新冠并不是源自中国

新冠病毒继续全球肆虐,美国、巴西等多国的单日新增病例数屡创新高。在奋力抗击新冠疫情的同时,全球多国科研人员也有了新发现。意大利、西班牙、巴西的研究人员前后在下水道废水中检出新冠病毒,而样本的收集时间均早于新冠在中国的爆发时间。

牛津大学专家汤姆·杰斐逊在接受英国《逐日电讯报》采访时表示,新冠病毒可能在世界各地处于休眠状态,在环境条件适合的情况下能被激活,并不是源自中国。汤姆·杰斐逊表示,愈来愈多的证据表明这类病毒在亚洲出现之前就已存在。

世卫组织:去年12月或已在乎大利传播

值得注意的是,意大利此前也被曝在去年12月份的废水样本中检出新冠病毒RNA片断。

据央视新闻,6月22日,针对上述发现,世卫组织卫生紧急项目负责人迈克尔·瑞安表示,这是重要的发现,需要进1步研究,有可能新冠病毒在去年12月份已在乎大利北部传播,而当时并没人意想到。问题是出现输入性病例之前,病毒在当地环境中的存在程度有多少,和其在疫情扩大至社区传播进程中起了甚么作用。

实际上,新冠病毒在欧洲地区传播时间提早的证据远不止出现在乎大利。

西班牙去年3月废水中检出新冠病毒

据新华社消息,西班牙巴塞罗那大学6月26日发布公告称,该校领导的1个研究小组在去年(2019年)3月收集的巴塞罗那废水样本中检测出新冠病毒。

公告称,巴塞罗那大学肠道病毒小组的研究人员对当地废水样本做了检测,结果发现在去年3月12日收集的废水中已有新冠病毒的踪影,此前该小组的研究人员已在今年1月15日的废水样本中检测到了新冠病毒的存在。而西班牙本土直到今年2月25日才报告首例新冠确诊病例。

领导该研究小组的生物学教授阿尔韦特·博什称,研究小组随后检查了2018和2019年的废水样本,目前唯一2019年3月12日的样本聚合酶链式反应(PCR)检测呈阳性,且病毒水平非常低,其他所有样本的检测结果均为阴性。他认为,巴塞罗那旅游业发达,游客众多,这1研究结果表明世界其他地区极可能也产生了类似情况,但许多病例或因被误诊为流感病例而被掩盖。

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巴西下水道废水中也检出新冠病毒

据新华国际7月3日消息,巴西圣卡塔琳娜联邦大学7月2日发表的1份研究报告说,由该校领衔的1个研究小组在圣卡塔琳娜州首府弗洛里亚诺波利斯市去年11月27日收集的废水样本中检测出新冠病毒。

这项研究结果目前已提交同行评审,如果终究确认,这次检测出的新冠病毒将是美洲地区目前发现的最早的新冠病毒样本。今年2月26日,巴西最大城市圣保罗确诊了该国首例新冠病例,也是拉丁美洲地区首例新冠确诊病例。

参与研究的圣卡塔琳娜联邦大学利用病毒学实验室的生物科技博士吉斯兰妮·丰加罗解释说,研究所用样本的收集时间是去年11月27日,而病毒感染人类需要几周时间,也就是说在收集到样本的15至20天前就已有人感染了。

吉斯兰妮表示,研究人员是在将废水样本中检测到的病毒与4组新冠病毒基因组进行了对照、且每一个样本最少进行8次测试后,才确认检测到的病毒为新冠病毒。研究小组在利用病毒学实验室得出结论后,又到圣卡塔琳娜联邦大学医院的份子、微生物和血清学实验室进行了检测,也都得出了相同结论。

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新冠病毒D614G突变,专家:在研疫苗不会变得无效

(健康时报记者 张彦婷 实习记者 李曌懿)当地时间7月3日,世卫组织在新冠肺炎例行发布会上表示,新冠病毒D614G变异可能致使病毒加速复制,且变异后的病毒被证明更具有沾染性。

7月6日中午,复旦大学附属西岳医院感染科主任张文宏微博发文表示:好消息是目前的证据还没法证实D614G突变病毒株的毒性更强,而且D614G突变不太可能对目前正在研制的疫苗的疗效产生重大影响。但是在疫情逐步进入深水区之际,后续还会有较多的不肯定性,还需要更多实验验证和监测的变异现象。

另外,世卫组织卫生紧急项目技术主管表示,其实2月份欧洲等地发现的初期病毒基因序列中就已出现变异,有研究显示29%的新冠病毒样本都出现了D614G变异。

近期,公众1直对病毒变异的程度及在研疫苗是不是能应对新变异的病毒等问题存在普遍耽忧,对此,宾夕法尼亚大学医学院病理及实验医药系研究副教授张洪涛表示,应正确认识病毒变异。从去年12月开始爆发以来延续至今,病毒的变异1直都在产生,这是1个自然产生的变化。变异在病毒从动物中间宿主传给人之前就产生了,本来有1些病毒是没法沾染给人体,但是通过不断的变异后,它就取得了能够侵入人体细胞的功能,进1步变异以后,沾染力增强,还能构成人体之间的相互沾染。病毒的变异,可使用“从量变引发质变”来进行比较通俗的解释。

变异的病毒有两种可能性。1是虽然传播性变强,但是感染后的后果没有那末严重。2是传播性不但变广,病毒的攻击性也变强了。据美国有线电视新闻网(CNN)3日报导称,变异后的病毒传播速度更快,但“致病性”没有增强,不会使病情加重。另有研究团队通过量化分析得出:病毒的变异也许正是新冠疫情如此迅速地在全球蔓延的缘由之1。

张洪涛指出,新冠病毒虽然产生了变异,但是突变的速度并没有流感病毒那末快,即使新冠病毒第2波再次来临,还是可以认为之前已感染过的人,依然具有免疫力。所以,如果在第1波感染以后已构成了群体免疫,那第2波疫情就不会太严重。

目前,有效新冠疫苗的交付暂无确切时间表,但到今年年底可能会有候选疫苗显示出对新冠病毒有效。在当地时间6月26日,世界卫生组织首席科学家苏米娅·斯瓦米纳坦谈到,目前全球正在研发新冠疫苗超过200个,其中15个已进入人体临床实验阶段。张洪涛表示,由于病毒变异速度较慢,1旦新冠疫苗研制成功,即使病毒株已变异了,疫苗也不会就变得无效。

而针对变异后的病毒沾染性是不是会更强,张洪涛认为,病毒的变异是没法禁止的,重要的是更加重视科学应对。首先不要恐慌,恐慌的出现会致使防疫效力下降。换句话说,即使病毒恶化,我们也有信心克服它,中国的预防及措施已做到了人类能做的极致。其次,目前的实际情况是往好的方向发展的,不管病毒是变强还是变弱,只要疫情还在,我们都只要做好该做的防护措施,戴口罩、勤洗手、少集会。

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总统戴上口罩吧!纽约州州长:否认疫情同等“病毒爪牙”

来源:央视网

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当地时间7月6日,美国纽约州州长科莫在疫情发布会上称新冠病毒是1个“重大”问题,并恳求特朗普不要成为“病毒的爪牙”。科莫表示,特朗普总统否认疫情就是在为新冠病毒的传播“推波助澜”。科莫说:“他助长了病毒的传播,他在制造病毒。”他再次呼吁特朗普要以身作则,佩戴口罩。

随着愈来愈多的人在美国被感染,特朗普继续淡化新冠病毒的危险。特朗普曾在7月4日发表独立日演讲时称,美国目前已对近4000万人进行检测,“通过检测,我们发现99%的病例是完全无害的”。

截至美东时间6日15时,美国累计新冠肺炎确诊病例已到达291万例,死亡病例数超过13万。